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菲利克斯打量着奥拉的办公室,这里堆满了资料,墙上挂着一幅孟德尔的画像,一幅达尔文的画像,在这两幅画像的中央,却挂着一幅描述亚当和夏娃在伊甸园中情形的油画,可能是拉菲尔某幅画的复制品,但看上去栩栩如生。
很有意思吧,奥拉笑着说,您看到的就是目前基因研究领域的精神状态。
菲利克斯又象上次一样很快切入正题:博士,我是一个分子生物学的外行,所以下面这个问题如果浅薄可笑请不要介意:据我所知,目前基因工程研究领域对各物种的遗传密码的测序工作只进行了很少的一部分,更不用提遗传密码的完全破译了。
在这种情况下,您如何能够实现我前面看到的不同物种之间的基因组合呢?您对计算机程序知道一些吗?奥拉反问,菲利克斯点了点头,如果您要把两个程序模块连接起来,并不需要完全读通这两个模块的全部程序代码,甚至完全不需要知道模块内部的情况,只需了解两个模块外部的数据接口,只要把数据接口正确连接,两个模块就合为一体了,尽管这时两个模块的内部对您仍是黑箱状态。
其实在很多年前,当分子生物学对各物种的基因信息知之甚少的时候,人们已经在干这种事了,比如有的研究者使果蝇的翅膀上长出了眼睛,甚至还有人使白鼠的背上长出人的耳朵......事实上,这种基因组合的难度和层次远低于对基因的直接修改。
我的实验室所做的最大贡献,就是把这项工作由以前的手工操作转为全自动化方式,这我将带您去看,但在这之前,我带你看另外一些东西,它会使您更加了解这项工作的意义。
奥拉领着菲利克斯走出了办公室,沿着来时的那条路走去,经过了来时的3号成长室,又经过了2号成长室,进入了1号成长室。
这个地方叫这个名称是不确切的,因为这里没有活着的东西。
奥拉说。
菲利克斯看到,在1号成长室中,立着一排排像书架一样的金属架子,上面密密麻麻地排放着无数小玻璃瓶,那些密封的玻璃瓶只有手指大小,奥拉告诉菲利克斯这样的标本瓶在这里有12万个,每一个瓶中都有一个基因组合的失败产物。
菲利克斯仔细看了看面前的一排标本瓶,浸泡在瓶里福尔马林液中的是一些形状模糊的糊状物;向前走过几排架子后,小瓶中开始出现一些更具实感的小残片,好像是无意中混入的一些木片树叶之类的杂物。
奥拉带着菲利克斯来到了2号成长室,这里同1号成长室一样,立着一排排放满标本瓶的高架子。
不同的是,在这些标本瓶中,菲利克斯找到了一些他能认出来的东西:一条昆虫的腿,一片残缺的翅膀,一个昆虫的脑袋......越向前走,标本瓶中昆虫的形态就越完整越清晰。
奥拉说:这些都是基因组合失败的产物,真正成功的能成活下来的基因组合体,就是刚进来时我带您看的那很少的几例了,它们是所有这20多万次组合试验中的幸运者,由此您也就能明白,我为什么把您马上要看到的那个系统命名为淘金者系统。
奥拉带着菲利克斯来到了下一层楼,这一层的墙壁都被打通了,形成了一个很大的车间。
奥拉首先让菲利克斯看两根手指粗细的玻璃管,管中都流淌着似乎一模一样的辱白色液体。
奥拉说:这就是淘金者系统的输入端,通过两根管子分别向系统中输入要进行组合的两种基因的细胞溶液菲利克斯看到,这两根管子在前面分开了,分别进入了两条流水线,这两条长长的流水线是由体积不大但数量繁多的机器组成的,两条流水线的机器精确对称,完全一样。
奥拉边走边介绍:这一段是物理分离提纯,这一段是细胞级的预处理,这一段已经比较精密了,是分子级的预处理......最后,两条流水线汇入一个巨大的金属球体中,菲利克斯看到了球体顶部立着一个塔状物。
您看,这就是淘金者系统的核心:基因组合舱。
那是电子显微镜吧?菲利克斯指着那个塔状物问。
是的,但同一般的电子显微镜不同,它的图像只提供给计算机。
对dna进行分析和破译的基本操作,包括用酶对碱基对的复制、对dna进行标记以及根据放she频谱对特定碱基对的检测,都是在计算机的控制下自动完成的。
计算机中的分子结构分析软件对dna分子进行分析,这当然还需一些预处理过程中其它设备采集的信息。
同时,计算机控制极其微小的分子探针,根据分析的数据对染色体进行操作,以实现基因组合。
这是一个极其精密复杂的系统。
请看,这些就电子显微镜输入计算机中的原始的分子图像菲利克斯看到,那些图像中只是一些形状和大小都变幻不定的幻影,看不到带状染色体,更看不到想象中的dna长链。
奥拉解释说:在这种尺度下,物质的量子效应变得明显了,人是很难理解这些图像的。
但菲利克斯想象中的长链在对面的一排大屏幕上可以看到,奥拉告诉他,这是计算机根据接收到的信息产生的dna分子链的三维模型。
链上那无数个小球的色彩组合似乎永不重复,整个长链伸向屏幕深处的无限远方,并不停地移动着。
菲利克斯觉得,他沿着那条色彩斑斓的长链,可以一直走到宇宙的尽头。
菲利克斯先生,这就是那首几十亿年的荷马史诗!
现在我们要修改它了,你看......屏幕上的那条长长的碱基分子链断开了,从屏幕的左上方又飘过了另一条分子链,它像一条在空中飘行的彩带,轻盈地插入了长链的断开处,两头很快和断点连接起来,与些同时响起了一声蜂鸣声,对面的一个大屏幕上显示的红色数字又加了1,标志着一对物种的基因组合的完成。
奥拉带着菲利克斯绕过组合舱来到它的另一面,菲利克斯看到,一长排试管正在从一个金属槽中源源不断地流出,奥拉告诉菲利克斯每一个试管都容纳着一个基因组合完成的胚胎细胞。
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